論文(原著論文)発表

(63) E.B. Starikov, T. Fujita, H. Watanabe, Y. Sengoku, S. Tanaka, and W. Wenzel, “Effects of Molecular Motion on Charge Transfer/Transport through DNA Duplexes with and without Base Pair Mismatch”, Mol. Sim., 32 (2006) pp. 759-764.
(62) T. Oda, S. Tanaka, and S. Hayase, “Analysis of Dominant Factors for Increasing the Efficiencies of Dye-Sensitized Solar Cells: Comparison Between Acetonitrile and Ionic Liquid Based Electrolytes”, Jpn. J. Appl. Phys. Part 1, 45 (2006) pp. 2780-2787.
(61) T. Oda, S. Tanaka, and S. Hayase, “Differences in Characteristics of Dye-Sensitized Solar Cells Containing Acetonitrile and Ionic Liquid-Based Electrolytes Studied Using a Novel Model”, Sol. Energy Mater. Sol. Cells 90 (2006) pp. 2696-2709.
(60) E.B. Starikov, S. Tanaka, N. Kurita, Y. Sengoku, T. Natsume, A. Quintilla, and W. Wenzel, “Ballistic Conductance for All-Atom Models of Native and Chemically Modified DNA: A Review of Kubo-Formula-Based Approach”, in "Modern Methods for Theoretical Physical Chemistry of Biopolymers", edited by E.B. Starikov, J.P. Lewis, and S. Tanaka (Elsevier B.V., Amsterdam, The Netherlands, 2006) pp. 535-546.
(59) Hitoshi Goto, Sigeaki Obata, Toshiyuki Kamakura, Naofumi Nakayama, Mitsuhisa Sato, Yoshihiro Nakajima, Umpei Nagashima, Toshio Watanabe, Yuichi Inadomi, Masakatsu Ito, Takeshi Nishikawa, Tatsuya Nakano, Lennart Nilsson, Shigenori Tanaka, Kaori Fukuzawa, Yuichiro Inagaki, Michiaki Hamada, and Hiroshi Chuman, “Drug Discovery Using Grid Technology”, in "Modern Methods for Theoretical Physical Chemistry of Biopolymers", edited by E.B. Starikov, J.P. Lewis, and S. Tanaka (Elsevier B.V., Amsterdam, The Netherlands, 2006) pp. 227-248.
(58) T. Nakano, K. Fukuzawa, Y. Mochizuki, S. Amari, and S. Tanaka, “Developments and Applications of ABINIT-MP Software Based on the Fragment Molecular Orbital Method”, in "Modern Methods for Theoretical Physical Chemistry of Biopolymers", edited by E.B. Starikov, J.P. Lewis, and S. Tanaka (Elsevier B.V., Amsterdam, The Netherlands, 2006) pp. 39-52.
(57) K. Fukuzawa, Y. Mochizuki, S. Tanaka, K. Kitaura, and T. Nakano, “Molecular Interactions between Estrogen Receptor and Its Ligand Studied by the ab Initio Fragment Molecular Orbital Method”, J. Phys.Chem. B, 110, 16102-16110 (2006).
(56) K. Fukuzawa, Y. Komeiji, Y. Mochizuki, A. Kato, T. Nakano and S. Tanaka, ““Intra- and Inter-molecular Interactions between Cyclic-AMP Receptor Protein and DNA: Ab initio Fragment Molecular Orbital Study”, J. Comp. Chem., 27, 948-960 (2006).
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(54)
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(53) 坂本久美子、神部順子、中田栄子、佐々木幹夫、中馬寛、山内あい子:「「妊娠と薬」に関する意識調査-薬剤師、薬学生、研究者の場合-」、医療薬学, 32(9), 956-963, 2006.
(52) M. Shirai, Y. Kawai, R. Yamanishi, T. Kinoshita, H. Chuman, and J. Terao, “Effect of a conjugated quercetin metabolite, quercetin 3-glucuronide, on lipid hydroperoxide-dependent formation of reactive oxygen species in differentiated PC-12 cells”, Free Radical Research, 40(10), 1047-1053, 2006.
(51) Zsolt Lepp, Takashi Kinoshita, and Hiroshi Chuman, “Screening for New Antidepressant Leads of Multiple Activities by Support Vector Machines”, J. Chem. Inf. Model., 46, 158-167, 2006.
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(33) T. Kinoshita, Z. Lepp, and H. Chuman, “Approach to novel functional foods for stress control 1. Toward structure-activity relationship and data mining of food compounds by chemoinformatics”, Journal of Medical Investigation, 52, 240-241 (2006).
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(31) X. Liu, H. Tanaka, A. Yamauchi, B. Testa, and H. Chuman, “Determination of lipophilicity by reversed-phase high-performance liquid chromatography: Influence of 1-octanol in the mobile phase”, J. Chromatogra. A 1091, 51-59 (2005).
(30) Z. Lepp and H. Chuman, “Connecting Traditional QSAR and Molecular Simulations of Papain Hydrolysis-Importance of Charge Transfer”, BioorganicMedicinal Chemistry 13, 3093-3105 (2005).
(29) H. Chuman et al., “Drug Discovery Using Grid Technology” (Chapter 12),
in “Modern Methods for Theoretical Physical Chemistry of Biopolymers” (Elsevier, 2006), in press.
(28) A. Ghaibeh, M. Sasaki, E. Nakata Doolin, K. Sakamoto, H. Chuman, and A. Yamauchi, "Using Computational Intelligence Methods In A Web-Based Drug Safety Information Community", Complex Medical Engineering (Springer-Verlag, 2006), in press.
(27) A. Yamauchi and H. Chuman, "Data Mining Approach on Clinical/Pharmaceutical Information accumulated in the Drug Safety Information Community", Complex Medical Engineering (Springer-Verlag, 2006), in press.

(26) Y. Mochizuki, K. Fukuzawa, A. Kato, S. Tanaka, K. Kitaura and T. Nakano, “A Configuration Analysis for Fragment Interaction” Chem. Phys. Lett., 410, 247–253 (2005).
(25) K. Fukuzawa, Y. Komeiji, Y. Mochizuki, A. Kato, T. Nakano and S. Tanaka “Intra- and Intermolecular Interactions Between Cyclic-AMP Receptor Protein and DNA: Ab initio Fragment Molecular Orbital Study” J. Comp. Chem., 27, 948-960 (2006).
(24) Y. Mochizuki, T. Ishikawa, K. Tanaka , H. Tokiwa, T. Nakano, and S Tanaka, ”Dynamic polarizability calculation with fragment molecular orbital scheme”, Chem. Phys. Lett. 418 (2006) 418.
(23) T. Ishikawa, Y. Mochizuki, T. Nakano, S. Amari, H. Mori, H. Honda, T. Fujita, H. Tokiwa, S. Tanaka, Y. Komeiji, K. Fukuzawa, K. Tanaka, and E. Miyoshi, “Fragment molecular orbital calculations on large scale systems containing heavy metal atom”, Chem. Phys. Lett., submitted.
(22) Y. Mochizuki, K. Yamashita, T. Nakano, T. Ishikawa, S. Amari, K. Segawa, T. Murase, H. Tokiwa, M. Sakurai, and K. Tanaka, ”A parallelized integral-direct CIS(D) method with multilayer fragment molecular orbital scheme”, J. Chem. Phys., submitted.
(21) K. Tanaka, Y. Mochizuki, T. Ishikawa, H. Terashima, and H. Tokiwa, “An efficient algorithm for parallel processing of a spin-adapted full configuration interaction”, J. Chem. Phys., submitted.
(20) K. Yamamoto, D. Abe, N. Yoshimoto, M. Choi, K. Yamagishi, H. Tokiwa, M. Shimizu, M. Makishima, and S. Yamada, “Vitamin D Receptor: Ligand Recognition and Allosteric Network”, Journal of Medicinal. Chemistry 49, 1313-1324 (2006)
(19) K. Yamagishi, K. Yamamoto, S. Yamada and H. Tokiwa, “Vitamin D Receptor: Ligand Recognition and Allosteric Network”, Chemical Physics Letters, submitted.
(18) K. Yamagishi, K. Yamamoto, S. Yamada and H. Tokiwa, “Functions of key residues in the ligand-binding pocket of vitamin D receptor: Fragment molecular orbital interfragment interaction energy analysis”, Chemical Physics Letters 420, 465-468 (2006).
(17) K. Yamagishi, K. Yamamoto, Y. Mochizuki, T. Nakano, S. Yamada and H. Tokiwa, “Flexible ligand recognition of peroxisome proliferators-activated receptor-γ(PPAR-γ)”, Journal of Medicinal. Chemistry, submitted.
(16) H. Ieiri, T. Ishimoto, H. Teramae and H. Tokiwa, “Conformational analysis of Glycine pentamer using an ab initio Hamiltonian Algorithm Molecular Dynamics method”, Chemical Physics Letters, submitted.
(15) E.B. Starikov, S. Tanaka, N. Kurita, Y. Sengoku, T. Natsume, and W. Wenzel, “Investigation of a Kubo-Formula-Based Approach to Estimate DNA Conductance in an Atomistic Model”, Euro. Phys. J. E 18 (2005) pp. 437-445.
(14) T. Natsume, K. Dedachi, S. Tanaka, T. Higuchi, and N. Kurita, “Charge Transfer through Double-Strand DNA and Its Base-Mismatched Ones: Theoretical Analysis Based on Semiempirical Molecular Orbital Calculations”, Chem. Phys. Lett. 408 (2005) pp. 381-388.
(13) P.W. Pan, R.J. Dickson, H.L. Gordon, S.M. Rothstein, and S. Tanaka, “Functionally-Relevant Protein Motions. Extracting Basin-Specific Collective Coordinates from Molecular Dynamics Trajectories”, J. Chem. Phys. 122 (2005) 034904
(12) E.B. Starikov, S. Tanaka, N. Kurita, Y. Sengoku, T. Natsume, A. Quintilla, and W. Wenzel, “Ballistic Conductance for All-Atom Models of Native and Chemically Modified DNA: A Review of Kubo-Formula-Based Approach”, in "Modern Methods for Theoretical Physical Chemistry of Biopolymers", edited by E.B. Starikov, S. Tanaka, and J.P. Lewis (Elsevier B.V., Amsterdam, The Netherlands, 2006), in press.
(11) T. Nakano, K. Fukuzawa, Y. Mochizuki, S. Amari, and S. Tanaka, “Developments and Applications of ABINIT-MP Software Based on the Fragment Molecular Orbital Method”, in "Modern Methods for Theoretical Physical Chemistry of Biopolymers", edited by E.B. Starikov, S. Tanaka, and J.P. Lewis (Elsevier B.V., Amsterdam, The Netherlands, 2006), in press.
(10) D.G. Fedorov and K. Kitaura, “Theoretical Development of the Fragment Molecular Orbital (FMO) Method”, in "Modern Methods for Theoretical Physical Chemistry of Biopolymers", edited by E.B. Starikov, S. Tanaka, and J.P. Lewis (Elsevier B.V., Amsterdam, The Netherlands, 2006), in press.
(9) 福澤薫、“量子化学計算でみるエストロゲン受容体と化学物質の相互作用”、バイオニクス20057月号, 65-67 (2005).
(8) 加藤昭史、福澤薫、望月祐志、甘利真司、中野達也、“BioStation Viewer: 生体高分子の相互作用の解析と可視化、可視化情報学会誌 20064月号(印刷中)
(7) H. Chuman, A. Mori, H. Tanaka, C. Yamagami, and T. Fujita, “Analyses of the Partition Coefficient, Log P, Using Ab Initio MO Parameter and Accessible Surface Area of Solute Molecules”, J. Pharm. Sci. 93(11), pp. 2681-2697 (2004).
(6) X. Liu, H. Tanaka, A. Yamauchi, B. Testa, and H. Chuman, “Lipophilicity Measurement by Reversed-Phase High-Performance Liquid Chromatography (RP-HPLC): A Comparison of Two Stationary Phases Based on Retention Mechanisms”, Helv. Chim. Acta. 87, pp. 2866-2876 (2004).
(5) H. Tanaka, X. Liu, D. Kawabata, H. Chuman, and C. Yamagami, “Application of a Stepwise Flow Ratiometry without Phase Separation to the Determination of the Chloroform/Water Distribution Coefficients of Volatile Diazines”, Chem. Pharm. Bull 53(4), pp. 374-377 (2005).
(4) 浜田道昭、馮誠、稲垣祐一郎、長嶋雲兵、村上和彰、中馬寛、「超高速計算環境での生体関連分子の活性・機能予測システムの構築:HIVプロテアーゼ阻害剤の解析への応用」日本応用数理学会論文誌 14(4) pp. 267-288 (2004).
(3) 山内あい子、中田栄子、佐々木幹夫、後藤尋規、坂本久美子、中馬寛、「医薬品安全性情報コミュニティの構築に向けて」月刊薬事 46(9), pp. 133-139 (2004).
(2) E. Miyoshi, H. Mori, R. Hirayama, Y. Osanai, T. Noro, H. Honda, and M. Klobkowski, "Compact and Efficient Basis Sets of s- and p-block Elements for Model Core Potential Method", J. Chem. Phys., Vol. 122, No. 7, pp. 074104-1-8 (2005).
(1) K. Morihashi, Y. Shimodo, and O. Kikuchi, “Liu-Parr-Nagy analysis on density functional theory  calculations of spin densities in first-row and diatomic hydrides”, J. Mol. Struct. (THEOCHEM), 722, pp. 169-183 (2005).




著作物

(3) E.B. Starikov, J.P. Lewis, and S. Tanaka, ed., “Modern Methods for Theoretical Physical Chemistry of Biopolymers” (Elsevier B.V., Amsterdam, The Netherlands, 2006).
(2) A. Ito, K. Sudo, S. Kumazawa, M. Kikuchi, and H. Chuman, “Three-Dimensional Modeling of Cytochrome P450 14alpha-Demethylase (CYP51) and Interaction of Azole Fungicide Metconazole with CYP51”, in ACS Symposium Series No. 892 New Discoveries in Agro-chemicals, American Chemical Society, Washington DC, 2004.
(1)
三好永作、総説「食塩結晶の色」日本海水学会誌57卷6号 pp. 555-562 (2004).




口頭発表(国際学会および主要な国内学会発表)

      招待講演

(24) 田中成典:「「奪われし未来」をめぐって」(大学連携「ひょうご講座」、環境科学の金字塔と今後への展開、2006104日、兵庫県立神戸学習プラザ、神戸)
(23) 田中成典:「生体電子物性と環境応答」(京都大学基礎物理学研究所研究会「環境物理学-先端領域の創出へ向けて-」、2006年6月16日、京都大学基礎物理学研究所、京都)
(22) Dmitri G. Fedorov, 北浦 和夫:"Systematically improvable calculations with the fragment molecular orbital method (FMO)", Satellite symposium of ICQC (岡崎市, 2006.5.18)
(21) 北浦和夫:All electron calculations of proteins using fragment molecular orbital (FMO) method, ICQC2006(京都, 2006.5.23
(20) 北浦和夫:"Quantum Chemical Calculations of Binding Energy between Protein and Ligand", 2006 Annual Meeting of CBI Sciety (東京, 2006.7.24)
(19) 北浦和夫:All electron calculations of FK506 binding protein complexes, ACS Annual Meeting 2006 (サンフランシスコ, 2006.9.12)
(18) H. Chuman, “Fundamental, Structure Based and Clinical QSAR”, 11th Asian Chemical Congress, Seoul, Republic of Korea, August 2005.
(17) H. Chuman, “Some Topics from Our research projects”, Asia Hub for e-Drug Discovery Workshop, Seoul, Republic of Korea, August 2005.
(16) H. Chuman, “Fundamental, Structure Based and Clinical QSAR”, 7回薬物の分子設計と開発に関する日中合同シンポジウム, 中国浙江省, September 2005.
(15) 福澤薫:“フラグメント分子軌道法の生体高分子への応用”(神戸大学発達科学部第122回自然環境論セミナー、神戸、20054月).
(14) K. Fukuzawa, “Application of Fragment Molecular Orbital Method for Biomolecular System”, Seminar at the Research Center in Karlsruhe, the Institute of Nanotechnology, June 2005, Karlsruhe, Germany
(13) K. Fukuzawa, “Application of Fragment Molecular Orbital Method for Biomolecular System”, Seminar at EML Research GmbH, June 2005, Heidelberg, Germany.
(12) K. Fukuzawa, “Application of Fragment Molecular Orbital Method for Biomolecular System”, Seminar at Masaryk University, Faculty of Science, June 2005, Brno, Czech Republic.
(11) 田中成典:「生体高分子の第一原理計算の最近の展開」(第19CAMMフォーラム2月例会本例会、2006年2月3日、虎ノ門パストラル、東京)
(11) S. Tanaka, “Development of Bio-Simulation Systems Based on the Fragment Molecular Orbital Method”JST-CREST・さきがけシンポジウム「電子状態計算における電子相関の諸問題」、2006126日、北海道大学、札幌)
(10) 田中成典:「生体高分子の第一原理コンピュータ・シミュレーションの展開」(兵庫県立大学工学部セミナー、2006117日、兵庫県立大学、姫路)
11. R. Maezono and S. Tanaka, “Biomolecular Calculations Using Ab Initio Quantum Monte Carlo Technique Combined with Fragment Molecular Orbital Method” (Symposium “Advances in Quantum Monte Carlo” in the 2005 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem 2005), December 19, 2005, Honolulu, Hawaii, USA).
(9) 田中成典:「DNAのナノ領域ダイナミクスの第一原理的解析」(「生命量子科学」研究会、2005624日、総合研究大学院大学葉山高等教育センター、神奈川県葉山町)
(8) T. Ogawa, T. Nakano, and S. Tanaka, “Application of MQEq (Modified Charge Equilibration) to the Biological System”QEq2005; The state of the arts of QEq (Charge Equilibration)2005525日、奈良県新公会堂、奈良市)
(7) 田中成典:「フラグメント分子軌道法に基づく生体分子計算システムの開発」(日本コンピューター化学会2005春季年会・特別講演、2005520日、東京工業大学、東京)
(6) 田中皓:「大きな分子に適用しても近似度の劣化をまねかない電子相関理論と高効率プログラムコードの作成にむけて」(「生命量子科学」研究会、2005624日、総研大、神奈川)
(5) K.Tanaka, “A New Algorithm for parallel processing of spin adapted CAS-CI calculations” (第1回チェコ日本理論化学シンポジューム、2005915)
(4) K. Tanaka, “MRCPA:theory and application to highly correlating system” (TC200520051214日、Kolkata, India)
(3) K. Tanaka, “Development of size-extensive methods; from small molecules to nano-scale systems” (JST-CREST-PRESTO Workshop: Correlation Issues in electronic structure calculations2006126日、札幌)
(2) 加藤昭史(みずほ情報総研)、「タンパク質相互作用可視化ビューワ:BioStation Viewer ―フラグメント分子軌道法を使って」、日本コンピュータ化学会2004年秋季年会(特別講演、東京、2004103日).
(1) 田中成典、「FMO法による核内受容体へのアプローチ」、第250CBI学会研究講演会(2005310日、日本化学会化学会館、東京).


       口頭講演    (国内 11件、国際 7件)

(18) H. Chuman, “Hydrophobicity and its Importance in Drug Discovery and Safety”, Seminar in Yonsei University, Seoul, Korea, May, 2006.
(17) 藤田貴敏、渡邉博文、田中成典:疎水性相互作用へのイオンによる影響の検討、(日本コンピュータ化学会、20066月、東京工業大学、東京)
(16) 中野達也:非経験的フラグメント分子軌道法プログラムABINIT-MPの開発-その実装と応用計算事例-、第14 CCSEワークショップ、(2006/6/30、東京)
(15) H. Mori and E. Miyoshi, “ Heavy Elements’ Chemistry with Analytic Derivatives of Relativistic Model Core Potential         Satellite Symposium of XII-th ICQC, Material-oriented Quantum Chemistry (May 27-29, 2006, Osaka, Japan)
(14) 塚本晋也,森寛敏,野呂武司館脇洋,三好永作:「相対論的モデル内殻ポテンシャルによる希土類塩化物の電子構造の理論的研究」(20059月,希土類若手研究会松島ホテル大観荘
(13) 森 寛敏,平山亮,長内有,野呂武司,本田宏明,M. Klobukowski, 三好永作:「モデル内殻ポテンシャル法による高精度理論スペクトロスコピー:電子相関・相対論効果用基底 MCP-xzp (x=d,t,q) の開発とその応用」(2005年7月,九重分光セミナー,九重共同研修所)
(12) X. Liu and H. Chuman, “Determination of solute lipophilicity by reversed-phase high-performance liquid chromatography (RP-HPLC)”, 2005 COE International Conference on Biological Mechanism for Stress Control, Tokushima, Japan, Proceeding 293-4, August 2005.
(11) T. Kinoshita, Z. Lepp, and H. Chuman, “The construction of a novel database for flavonoids”, 2005 COE International Conference on Biological Mechanism for Stress Control”, Tokushima, Japan, Proceeding 240-1, August 2005.
(10) Z. Lepp, T. Kinoshita, and H. Chuman, “Virtual Screening Models for Finding Novel Antidepressants”, 2005 COE International Conference on Biological Mechanism for Stress Control, Tokushima, Japan, Proceeding 297-9, August 2005.
(9) A. Yamauchi and H. Chuman, “Data Mining Approach on Clinical/Pharmaceutical Information Accumulated in the Drug Safety Information Community”, The First International Conference on Complex Medical Engineering-CME2005, Takamatsu, Japan, May 2005.
(8) A. Ghaibeh, M. Sasaki, E. N. Doolin, K. Sakamoto, H. Chuman, and A. Yamauchi, “Using Computational Intelligence Methods In A Web-Based Drug Safety Information Community”, The First International Conference on Complex Medical Engineering-CME2005, Takamatsu, Japan, May 2005.
(7) 福澤薫, 望月祐志, 田中成典, 北浦和夫, 中野達也:“フラグメント分子軌道法による、エストロゲン受容体-リガンド相互作用の理論的研究”(第9回理論化学討論会, 京都, 20055月)
(6) 下堂靖代、守橋健二、ABINIT-MPプログラムによるフラグメント-DFT計算の性能評価“(日本化学会第86回春季年会、船橋、2006年3月)
(5) 守橋健二、高橋史朗、下堂靖代、DNA鎖合成過程のモデル反応についてのDFT計算”(日本化学会春季年会、船橋、20063月)
(4) 田中皓,石川岳志,常盤広明,望月祐志:「グラフ表示の閉殻と開殻への分離による CASCIの並列、ベクトル処理アルゴリズム」(分子構造総合討論会、東京、20059月)
(3) 田中秀治Xiangli Liu、川端大地2、中馬寛、山上知佐子31徳島大院薬、2徳島大薬、 3神戸薬大)「段階的流量比法/非相分離吸光光度検出による揮発性物質の配分係数の測定」、第45回フローインジェクション分析講演会(福岡、20041126日).
(2) 白井睦子、木下崇司、中馬寛、寺尾純二(徳島大院薬)、「神経細胞モデルPC12培養細胞の酸化ストレスに対するケルセチン代謝物の作用」、第9回日本フードファクター学会(兵庫、20041267日).
(1) 関谷雅弘、野呂武司、長内有、三好永作、古賀俊勝、CeからLuのランタノイド元素に対する相対論効果を考慮した電子相関用基底関数」、分子構造総合討論会20049月、広島国際会議場.


       ポスター発表

(84) 福澤薫、中野達也、望月祐志、田中成典:エストロゲン受容体とリガンドの結合性:フラグメント分子軌道法による相互作用解析” 2006分子構造総合討論会、静岡 (20069)
(83) K. Fukuzawa, Y. Komeiji, Y. Mochizuki, A. Kato, Tatsuya,Nakano, and S. Tanaka, “Intra- and intermolecular interactions between cyclic-AMP receptor protein and DNA: Ab initio fragment molecular orbital study”, 2006 Annual meeting of CBI society, July 2006, Tokyo, Japan.
(82) K. Fukuzawa, Y. Komeiji, Y. Mochizuki, A. Kato, T. Nakano, and S, Tanaka, “Intra- and intermolecular interactions between cyclic-amp receptor protein and DNA: Ab initio fragment molecular orbital study”, XIIth International Congress of Quantum Chemistry (ICQC), May 2006, Kyoto, Japan.
(81) K. Fukuzawa, Y. Mochizuki, S. Tanaka, K. Kitaura And T. Nakano, “Molecular Interactions Between Estrogen Receptor and its Ligand studied by the ab initio fragment molecular orbital method”, XIIth International Congress of Quantum Chemistry (ICQC), May 2006, Kyoto, Japan.
(80) 守橋健二、下堂靖代、中野達也:「フラグメント-DFT 法による核酸塩基対の水素結合およびスタッキング相互作用 」、分子構造総合討論会 2006(静岡)、2P071.
(79) 下堂靖代、中野達也、守橋健二:「種々の交換相関汎関数によるフラグメント-DFT 計算精度 」、分子構造総合討論会 2006(静岡)、4P065.
(78) Y. Shimodo, T. Nakano, K. Morihashi, "Numerical integration accuracy on fragment-DFT calculations for small polypeptides", International Congress of Quantum Chemistry (Kyoto) 2006, C071.
(77) Y. Shimodo, and K. Morihashi, "Density functional calculations and Liu-Parr-Nagy analysis on spin densities in second-row diatomic hydrides", International Congress of Quantum Chemistry (Kyoto) 2006, D161.
(76) Z. Lepp, T. Kinoshita, and H. Chuman, “Virtual Screening Models for Predicting Activities in Various Therapeutic Areas”, CBI学会2006年大会, 東京, 7, 2006.
(75) T. Kinoshita, Z. Lepp, Y. Kawai, J. Terao, and H. Chuman, “An Integrated Database of Flavonoids”, CBI学会2006年大会, 東京, 7, 2006.
(74) K. Yamagishi, K. Yamamoto, S. Yamada, and H. Tokiwa, “Functions of the key residues in the ligand-binding pocket of vitamin D receptor: Fragment molecular orbital-interfragment interaction energy analysis”, CBI学会2006年大会, CBI学会2006年大会, 東京, 7, 2006.
(73) K. Yamagishi, Hi. Chuman, K. Fukuzawa, K. Yamamoto, S. Yamada, H. Tokiwa, “Ab initio Fragment Molecular Orbital Method and its Application to Huge Biomolecular Systems”, Asia Hub e-Drug Discover (AHeDD) Symposium, Seoul, Korea, May, 2006.
(72) 渡邉博文、田中成典、杉村乾次、武石祥史、榎本平:二酸化炭素固定酵素Rubisco改良に向けた分子シミュレーション、(分子構造総合討論会、20069月、グランシップ、静岡)
(71) 伊藤三香、福澤薫、望月祐志、石川岳志、中野達也、田中成典:レチノイドXレセプターのヘリックス12に関する理論的研究、(分子構造総合討論会、20069月、グランシップ、静岡)
(70) 藤田貴敏、渡邉博文、田中成典:疎水性相互作用へのイオンによる影響の検討、(分子構造総合討論会、20069月、グランシップ、静岡)
(69) H. Watanabe, T. Fujita, E. B. Starikov, W. Wenzel, R. Maezono, K. Fukuzawa, T. Nakano and S. Tanaka, ”Ab initio Studies on electronic structure of DNA”, (Charge Migration in DNA, University of Manitoba, June 2006, Winnipeg,  Canada)
(68) H. Watanabe, R. Maezono and S. Tanaka, ”A Combinatorial Approach of Quantum Monte Carlo Method and Fragment Molecular  Orbital Method”, ICQC2006 The XIIth International Congress of Quantum Chemistry2006年5月、京都テルサ、京都)
(67) H. Watanabe, S. Tanaka, K. Sugiura, Y. Takeishi and T. Enomoto, ”Computational Study for Improvement of Carbon Fixation Enzyme, Rubisco, with Fragment Molecular Orbital Method”, ICQC2006The XIIth International Congress of Quantum Chemistry2006年5月、京都テルサ、京都)
(66) Y. Mochizuki, K. Yamashita, T. Nakano, T. Ishikawa, S. Amari, K. Segawa, T. Murase, H. Tokiwa, M. Sakurai, and K. Tanaka, A parallelized integral-direct CIS(D) method with multilayer fragment molecular orbital scheme, ICQC2006」(京都)D158
(65) K. Tanaka, Y. Mochizuki, T. Ishikawa, H. Terashima, and H. Tokiwa, An efficient algorithm for parallel processing of a spin adapted full configuration interaction, ICQC2006」(京都)D158
(64) 石川岳志、望月祐志、中野達也、甘利真司、森寛敏、本田宏明、藤田貴俊、常盤広明、田中成典、古明地勇人、福澤薫、田中皓、三好永作:FMO法へのMCPの導入と生体分子系への適用、「分子構造総合討論会」(静岡)3P062
(63) M. Gajewski, M. Klobukowski, J. Tuszynski and E. Miyoshi, DFT and MP2 Calculations on the Electronic Structure and Geometry of 18-Crown-6, Hexa-Aza-18-Crown-6 and their Complexes with Cations”, VI-th Canadian Computational Chemistry Conference (CCCC6), (July 26-30, Vancouver, Canada)
(62) T. Zeng*, Z. Jamshidi#, E. Miyoshi= and M. Klobukowski, Quantum Chemistry Studies on Oxohalides and Thiohalides of Phosphorus, APX3 (A = O, S and X = Br and I)”, VI-th Canadian Computational Chemistry Conference (CCCC6), (July 26-30, Vancouver, Canada)
(61) M. S. Mon, H. Mori, and E. Miyoshi, “Theoretical study for electronic structure of molecular switching compound”, XII-th International Congress of Quantum Chemistry (ICQC), (May 21-26, 2006, Kyoto, Japan)
(60) H. Mori and E. Miyoshi, “Development of analytical energy derivatives for model core potential (MCP) method: toward large-scale relativistic quantum chemical calculation”, XII-th International Congress of Quantum Chemistry (ICQC), (May 21-26, 2006, Kyoto, Japan)
(59) H. Mori and E. Miyoshi, “Theoretical design of proton-electron coupled system for optical molecular memory”, XII-th International Congress of Quantum Chemistry (ICQC),  (May 21-26, 2006, Kyoto, Japan)
(58) M. Mine, H. Mori, T. Tsutsui, and E. Miyoshi, “Computational research of benzene trimer cation by ab initio method”, XII-th International Congress of Quantum Chemistry (ICQC), (May 21-26, 2006, Kyoto, Japan)
(57) T. Noro, M. Sekiya, Y. Osanai, E. Miyoshi, T. Koga, H. Tatewaki, Web application of segmented CGTF basis sets for the atoms from H to Lr”, XII-th International Congress of Quantum Chemistry (ICQC), (May 21-26, 2006, Kyoto, Japan)
(56) M. Kondo, H. Mori, and E. Miyoshi, “Structures, electronic states, and substituent and solvent effects of organic electroluminescent Zinc(II) complex: a density functional study”, XII-th International Congress of Quantum Chemistry (ICQC), (May 21-26, 2006, Kyoto, Japan)
(55) S. Tsukamoto, H. Mori, S. Irle, K. Morokuma, H. Tatewaki, and E. Miyoshi, Chemical interaction analysis of tripods containing lanthanide elements”, XII-th International Congress of Quantum Chemistry (ICQC), (May 21-26, 2006, Kyoto, Japan)
(54) Y. Terasaka, E. Miyoshi, Y. Hikosaka, T. Aoto, and K. Ito,  “ Inner valence states of NO+ ion and dissociation dynamics”, XII-th International Congress of Quantum Chemistry (ICQC), (May 21-26, 2006, Kyoto, Japan)
(53) 近藤真之,森寛敏,三好永作:「有機 EL 亜鉛錯体の密度汎函数法による理論研究」、 (20065月,有機EL討論会,日本未来科学館)
(52) 石川岳志,望月祐志,常盤広明,中野達也,田中皓,森寛敏,三好永作:フラグメント分子軌道法のナノ・表面系への展開」、 (20067月,大規模・高速度電子状態計算手法に関する研究会,大阪大学)
(51) 近藤真之,森寛敏,三好永作:「有機EL錯体Bis [2-(o-hydroxyphenyl)benzothiazole] Zinc(II)の密度汎函数法による理論研究」、(20067月,九重分光セミナー)
(50) 寺坂元寿,三好永作:NO+イオンの解離ダイナミクスについての理論研究」、(20067月,九重分光セミナー)
(49) 森 寛敏,三好 永作:水素結合型金属錯体と混合原子価状態を組み合わせたプロトン−電子連動系の理論設計」、20069月,錯体化学討論会,広島大学)
(48) 塚本 晋也,森 寛敏,舘脇 洋,三好 永作:相対論的モデル内殻ポテンシャル(MCP)法によるランタノイド化合物の電子状態計算」、(20069月,分子構造総合討論会,静岡)
(47) 寺坂元寿,三好永作,彦坂泰正,青戸智浩,伊藤健二:NO+イオンの内部原子価状態とその解離ダイナミクス」、(20069月,分子構造総合討論会,静岡)
(46) 舘脇洋,渡辺祥弘,山本茂義,三好永作:4成分相対論CI計算によるGdF分子の励起状態の解析」、(20069月,分子構造総合討論会,静岡)
(45) 三好永作,森寛敏,塚本晋也,峰雅紀,野呂武司:アクチニド元素に対する相対論的モデル内殻ポテンシャルの開発」、(20069月,分子構造総合討論会,静岡)
(44) 雅紀寛敏筒井哲夫三好永作:ab initio法によるベンゼンクラスターカチオンの理論的研究」、(20069月,分子構造総合討論会,静岡)
(43) 大場広明雅紀寛敏三好永作:相対論的モデル内殻ポテンシャル(MCP)法によるカルコゲンクラスターの電子構造に関する理論的研究」、(20069月,分子構造総合討論会,静岡)
(42) 中島久樹,森寛敏,Mon Ma San,三好永作:相対論的モデル内殻ポテンシャル(MCP)法による金含有ナノクラスターの電子構造に関する理論的研究」、(20069月,分子構造総合討論会,静岡)
(41) 近藤真之,森寛敏,三好永作:有機ELビス−2−オルトヒドロキシフェニルベンゾチアゾール錯体の理論研究〜発光特性の追究〜」、(20069月,分子構造総合討論会,静岡)
(40) Mon Ma San,森寛敏,塚本晋也, 三好永作:ランタニド一価イオンによる化学結合切断過程に関する理論的研究:相対論的モデル内殻ポテンシャル(MCP)法による反応解析20069月,分子構造総合討論会,静岡)
(39) 森寛敏,Mike Schmidt,塚本晋也,峰雅紀,中島久樹,大場広明,三好永作:相対論的モデル内殻ポテンシャルによる分子構造最適化プログラムの開発とその応用」、(20069月,分子構造総合討論会,静岡)
(38) 石川岳志,望月祐志,中野達也,甘利真司,森寛敏,藤田貴俊,常盤広明,田中成典,古明地勇人,福澤薫,田中皓, 三好永作:FMO法へのMCPの導入と生体分子計への適用」、(20069月,分子構造総合討論会,静岡)
(37) 関谷雅弘野呂武司, 長内有, 古賀俊勝, 松山永,三好永作:「ThからLrのアクチノイド元素に対する相対論効果を考慮した電子相関用基底関数」、(20069月,分子構造総合討論会,静岡)
(36) H. Mori, H. Chishaki, Y. Hirayama, Y. Katahira, T. Tsutsui, and E. Miyoshi, “Electronic Structure of Organic Electroluminescent Complex, Bis[2-(o-hydroxyphenyl) benzoxazole] Zinc(II): Dimer or Monomer? Steric Effect and Solvent Effect”, The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (PACIFICHEM 2005) (15-20 Dec. 2005, Honolulu, Hawaii, USA).
(36) H. Mori, M. Tadokoro, and E. Miyoshi, “Theoretical compass to design an optically durable molecular memory: An ab initio electronic-structure study on Proton-Electron coupled inorganic complex”, The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (PACIFICHEM 2005) (15-20 Dec. 2005, Honolulu, Hawaii, USA).
(35) D. Shigyo, H. Mori, T. Ogawa, T. Yoshitake, and E. Miyoshi, “Density functional theory calculations on electronic structures of ferromagnetic Fe3Si thin film: Which surface is the best for spintronics device?”, The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (PACIFICHEM 2005) (15-20 Dec. 2005, Honolulu, Hawaii, USA).
(34) S. Tsukamoto, H. Mori, T. Noro, H. Tatewaki, and E. Miyoshi, “Model Core Potential Calculations on electronic structures of Lanthanide Compounds”, The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (PACIFICHEM 2005) (15-20 Dec. 2005, Honolulu, Hawaii, USA).
(35) H. Anjima, E. Miyoshi, T. Noro, and H. Tatewaki, “Development of Model Core Potentials for Transradon elements and their Applications to Some Solvent Systems”, The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (PACIFICHEM 2005) (15-20 Dec. 2005, Honolulu, Hawaii, USA).
(34) 野呂武司,関谷雅弘,長内有,三好永作,古賀俊勝,舘脇洋:基底関数のための web application の開発」(20059月,分子構造総合討論会,タワーホール船越
(33) 安島英孝,森寛敏,塚本晋也,峰雅紀,M. Klobukowski三好永作:「sブロック元素の新しいモデル内殻ポテンシャルとその応用」(20059月,分子構造総合討論会,タワーホール船越
(32) 安島英孝,三好永作:「重元素を含むキレート化合物の電子状態の理論研究」(20059月,分子構造総合討論会,タワーホール船越
(31) 塚本晋也,森寛敏,野呂武司館脇洋,三好永作:「モデル内殻ポテンシャル(MCP) を使ったランタノイドハロゲン化物の電子構造」(20059月,分子構造総合討論会,タワーホール船越
(30). Z. Lepp and H. Chuman, “Linking Molecular Simulations and Classical QSAR Analysis of Protein-ligand Complexes”, 日本コンピュータ化学会2005秋季年会, 徳島、200510.
(29). 吉田達貞、中馬寛, “ACE-阻害薬複合体の分子軌道法による相互作用解析”, 日本コンピュータ化学会2005秋季年会, 徳島, 200510. 小田木郷、吉田達貞、中馬寛, “HIV-1 Proteaseと環状尿素系阻害薬の分子軌道法による相互作用解析(3”, 33回構造活性相関シンポジウム, 大阪, 200511.
(29) 糸川大祐、村上良真、西岡大貴、福島淳治、山内あい子、中馬寛, “CYP2B, 3Aおよび51とアゾール系化合物との結合相互作用の解析”, 33回構造活性相関シンポジウム, 大阪, 200511.
(28) X. Liu, H. Tanaka, A. Yamauchi, B. Testa, and H. Chuman, “Determination of lipophilicity by reversed-phase high-performance liquid chromatography (RP-HPLC)”, 33回構造活性相関シンポジウム, 大阪, 200511.
(28) Z. Lepp, 木下崇司、中馬寛, “Screening for New Antidepressant Leads of Multiple Activities by Support Vector Machines”, 33回構造活性相関シンポジウム, 大阪, 200511.
(27) 川和田美里、山岸賢司、寺前裕之、中馬寛、常盤広明, “HIV-1PR阻害薬のファーマコファアに関する理論的研究”, 24回メディシナルケミストリーシンポジウム, 大阪, 講演要旨集136-137, 200511.
(26) Z. Lepp, T. Yoshida, S. Odagi, and H. Chuman, “Connecting Traditional QSAR and Molecular Simulations - Structure Based Quantitative Structure-Activity Relationship of Papain and HIV-1-Protease Inhibitors”, Pacifichem 2005, Honolulu, Hawaii, U.S.A., December 2005.
(25) Z. Lepp, T. Kinoshita, and H. Chuman, “Virtual Screening Models for Lead Selection in Broad Therapeutic Areas”, MedChem Europe, Prague, Czech Republic, February 2006.
(24) 木下崇司、Z. Lepp、河合慶親、寺尾純二、中馬寛, “機能性食品設計のためのフラボノイドデータベース構築”, 2006年度日本農芸化学大会, 京都, 20063.
(23) K. Fukuzawa, Y. Mochizuki, S. Tanaka, K. Kitaura And T. Nakano “Molecular Interaction Between Estrogen Receptor and Their Ligands” CBI 2005 Chem-Bio Informatics in Post Genome Era, August 2005, Yokohama, Japan.
(22) 福澤薫,望月祐志,中野達也,北浦和夫,田中成典“フラグメント分子軌道法による、エストロゲン受容体-リガンド相互作用の理論的研究”(2005分子構造総合討論会,東京,200510月)
(21) 守橋健二、泉智恵美、下堂靖代、DNA鎖合成過程のモデル反応についてのDFT計算”(2005分子構造総合討論会、東京、20059月)
(20) 渡辺博文,田中成典,杉村乾次,武石祥史,榎本平:「二酸化炭素固定酵素Rubisco改変のためのフラグメント分子軌道計算」(日本コンピュータ化学会2005秋季年会、徳島、200510月)
(19) 前田紘輔,A. Schug,福澤薫,渡邉博文,田中成典:「エストロゲン受容体のリガンド結合エネルギーへのアミノ酸変異の効果」(日本コンピュータ化学会2005秋季年会、徳島、200510月)
(18) 藤田貴敏,渡邉博文,田中成典:「分子動力学シミュレーションによる溶媒和効果の検討」(日本コンピュータ化学会2005秋季年会、徳島、200510月)
(17) 望月祐志,中野達也,石川岳志,福澤薫,加藤昭史,田中皓,常盤広明,甘利真司,北浦和夫,田中成典:「ABINIT-MPプログラムの最近の機能拡張」(分子構造総合討論会、東京、20059月)
(16) K. Fukuzawa (Mizuho Information & Research Institute, Inc.), Y. Mochizuki, S. Koikegami (Advancesoft corporation) S. Tanaka (Kobe University), S. Amari (The University of Tokyo), K. Kitaura (National Institute for Advanced Industrial Science and Technology), and T. Nakano (National Institute of Health Sciences), “Fragment Molecular Orbital Study on Molecular Interaction Between Estrogen Receptor and Their Ligands”, WATOC2005 (World Association of Theoretically Oriented Chemists, January 2005, Cape Town, South Africa).
(15) Z. Lepp and H. Chuman (The Univ. of Tokushima), “Investigating the Links Between Traditional QSAR Approach and Molecular Simulations of Protein-Ligard Binding”, 32回構造活性相関シンポジウム(つくば、20041129日-121日).
(14) X Liu, H. Tanaka, A. Yamauchi, H. Chuman, and B. Testa (The Univ. of Tokushima andCHUV of Switzerland), “Structural properties governing retention mechanisms on RP-HPLC stationary phases used for lipophilicity measurement”, 32回構造活性相関シンポジウム(つくば、20041129日-121日).
(13) 日比野有紀、藤原崇、小林進一、木原勝、坂本久美子、山内あい子、中馬寛(徳島大院薬)、「薬物の胎盤通過性と母乳移行性のQSAR解析-Clinical QSAR(2)」、第32回構造活性相関シンポジウム(つくば、20041129日-121日).
(12) 吉田達貞、小田木郷2、中馬寛徳島大院薬、 2徳島大薬)、「HIV-1 protease cyclic urea系化合物の相互作用解析とQSAR」、第32回構造活性相関シンポジウム(つくば、20041129日-121日).
(11) 糸川大祐、村上良真、山内あい子、中馬寛(徳島大院薬)、「CYP2Bおよび3Aとアゾール系化合物との結合相互作用の解析」第32回構造活性相関シンポジウム(つくば、20041129日-121日).
(10) 浜田道昭、稲垣祐一郎、中馬寛2みずほ情報総研、徳島大院薬)、「Grid技術とXMLデータベースを用いた創薬プラットフォームの構築とその応用」、第32回構造活性相関シンポジウム(つくば、20041129日-121日).
(9) X. Liu, H. Tanaka, A. Yamauchi, B. Testa, and H. Chuman (The Univ. of Tokushima and CHUV of Switzerland), “Lipophilicity screening by reversed-phase high-performance liquid chromatography (RP-HPLC): interpretation and application”, Screening Europe (Geneve, Switzerland, Feb. 2005).
(8) 木下崇司1Zsolt Lepp1、白井睦子2、河合慶親2、寺尾純二2、中馬寛1 (1徳島大院薬、2徳島大院医) 、「機能性食品設計のためのフラボノイドデータベース構築」、農芸化学学会(札幌、200532830日).
(7) 小林進一、日比野有紀、藤原崇、木原勝、坂本久美子、山内あい子、中馬寛(徳島大院薬)、「薬物の胎盤通過性に関するQSAR解析の試み」、日本薬学会第125年会(東京、200532931日).
(6) 坂本久美子、神部順子、中田栄子、佐々木幹夫、後藤尋規、中馬寛、山内あい子 徳島大院薬、大東文化大外、NTT東日本関東病院薬、セイラシステム)、「「妊娠と薬」に関する意識調査-薬剤師、薬学生、研究者の場合-」日本薬学会第125年会(東京、200532931日).
(5) 長内有、野呂武司、森寛敏、平山亮、本田宏明、M. Klobukowski三好永作、「相関用分極函数を付随したモデル内殻ポテンシャル(MCP)の基底函数の提案」、分子構造総合討論会20049月、広島国際会議場.
(4) 安島英孝、三好永作、フランシウム、ラジウムのモデル内殻ポテンシャルの開発とその応用」、分子構造総合討論会20049月、広島国際会議場.
(3) 執行大輔、森寛敏、吉武剛、三好永作、強磁性Fe3Si結晶の表面電子状態についての密度汎函数計算」、分子構造総合討論会20049月、広島国際会議場.
(2) 平山亮、柴崎昭宏、長内有、三好永作、N2+イオンの内部原子価状態と解離ダイナミクス」、分子構造総合討論会20049月、広島国際会議場.
(1) 柴崎昭宏、山本典史、野呂武司、三好永作、スピン軌道相互作用を考慮したCI計算によるBiH分子のポテンシャル曲線とそのダイナミクス」、分子構造総合討論会20049月、広島国際会議場.